بينما تكون المضادات الحيوية حليفة قوية بمساعدة الجسم في محاربة مختلف الأمراض؛ لكنها يمكن أن تقوم أيضاً بإحداث أضرار تتعدى الفائدة إذا استُخدمت في حالات خاطئة، كتدمير الجهاز المناعي وقتل البكتيريا الحميدة في الجسم.
يجب وصف المضادات الحيوية فقط لعلاج المشاكل الصحية مثل: