هناك العديد من الأدوية التي تُستخدم ما بعد إجراء العمليات الجراحية بالمجمل كمسكنات الألم، والمضادات الحيوية للوقاية من الإصابة بالعدوى البكتيرية الناتجة عن العملية الجراحية، بالإضافة إلى مضادات الغثيان والقيء أحيانًا، وغيرها من الأدوية اعتمادًا على نوع العملية الجراحية، وتجدر الإشارة إلى أنَّ مسكن الألم الأقل ضررًا على المعدة هو الباراسيتامول المعروف أيضًا بالأسيتامينوفين (كالبنادول)، ولكن تستدعي الحاجة في بعض الأحيان تناول مسكنات أقوى للألم منه خصوصّا ما بعد العمليات الجراحية الكبيرة كالجراحات العظمية التي غالبًا ما تستدعي استخدام أدوية أشباه الأفيونات كالمورفين لتسكين الأمل. ويختلف المضاد الحيوي المناسب باختلاف العملية الجراحية واعتمادًا على نوع البكتيريا الأكثر خطرًا للتسبُّب بالعدوى.

يوجد هناك العديد من الطرق للتخفيف من تأثير الأدوية على المعدة، فيمكن إعطاء أدوية مثبطات البروتين كالأوميبرازول أو مضادات الهيستامين النوع الثاني او غيرها، وذلك اعتمادًا على خصائص ومعايير معينة، وحسب رأي الطبيب.