هي عبارة عن مناطق خصبة بيولوجيًا (توزيع غني للنباتات والحيوانات) ومهددة بشدة، وبعبارة أخرى هذه المناطق الجغرافية الحيوية منتجة للغاية، وتتعرض باستمرار لتهديدات التدمير التي تستدعي الحاجة إلى حمايتها، ومن الأمثلة على النقاط الساخنة للتنوع البيولوجي: موائل الغابات، حيث يواجهون باستمرار الدمار والتدهور بسبب قطع الأشجار غير القانوني والتلوث وإزالة الغابات.
وفقًا لإصدار (مايرز 2000) من خريطة النقاط الساخنة فإن المنطقة تكون مؤهلة كنقطة ساخنة للتنوع البيولوجي إذا استوفت معيارين، أولاً يجب أن تحتوي على ما لا يقل عن 1500 نوع من النباتات الوعائية، وذلك باعتبارها متوطنة، ثانيًا يجب أن تكون مهددة إلى جانب فقدان ما لا يقل عن 70٪ من الغطاء النباتي الأساسي.
كما يوجد ما يقرب من 36 منطقة حول العالم مؤهلة كنقاط ساخنة للتنوع البيولوجي، وهي تدعم حوالي 60٪ من أنواع الطيور والزواحف والثدييات والنباتات والبرمائيات في العالم – ومعظم هذه الأنواع متوطنة.
يعد تنوع الأنواع النباتية والحيوانية في العالم ككل أهم الوحدات الأساسية لأنظمة دعم الحياة على الأرض، وفيما يلي السببان الرئيسيان اللذان يحددان أهمية النقاط الساخنة للتنوع البيولوجي على الأرض:
ساهمت الأنشطة البشرية في معدلات الانقراض السريعة خاصة بسبب تدمير الموائل، وأن القلة التي لا تزال متبقية وخاصة تلك التي لديها ثراء من حيث الأنواع والجينات والنظم البيئية تواجه أيضًا الدمار باستمرار، وفيما يلي أكثر النقاط الساخنة للتنوع البيولوجي المهددة في العالم: